Η ριζική απόξεση είναι η επέκταση της παραπάνω διαδικασίας κάτω από το επίπεδο των ούλων, μέσα στο θύλακο, στα σημεία, όπου υπάρχει περιοδοντίτιδα και επεκτείνεται και στην επιφάνεια της ρίζας του δοντιού. Γίνεται με τη χρηση τοπικής αναισθησίας, ώστε να είναι ανώδυνο. Συνήθως, γίνεται ανά τεταρτημόρια.